A kutatócsoport vezetője: Prof. Dr. Antal-Szalmás Péter, MD, PhD, DSc

Tagok: Dr. Bence Dóra MD, PhD; Lajszné Dr. Tóth Beáta MSc, PhD; Dr. Nagy Gábor MD; Dr. Pénzes-Daku Krisztina MSc PhD

Asszisztens: Török Gáborné

Háttér: Kutatócsoportunk 20 éves tapasztalattal rendelkezik új biomarkerek felfedezésében és ismert markerek új alkalmazási területeinek azonosításában. Az elmúlt évek során számos különböző betegségcsoport esetében végeztünk vizsgálatokat: autoimmun kórképek, fertőzések, cirrhosis és daganatok.

Kutatási területek:

1., Az egyik kutatási területünk ismert és új autoantitestek diagnosztikai hasznának tesztelése különböző autoimmun megbetegedésekben (SLE, Sjögren szindróma, Poly/dermatomyositis, Autoimmun májbetegségek). Egyrészt kereskedelmi forgalomban kapható autoantitest assay-k - analitikai és klinikai - hatékonyságát vizsgáljuk ezekben a kórképekben, másrészt új autoantitestek azonosítását végezzük proteomikai módszerek segítségével. Ezentúl matematikai eljárások segítségével az egyedi markereknél hatékonyabb kompozit paramétereket állítunk elő és tesztelünk le. A laboratórium adatbázisában található nagymennyiségű adat ("big data") analízisével az alkalmazott tesztek analitikai és klinikai teljesítőképességét tudjuk értékelni. Az indirekt immunfluoreszcens tesztek esetében a számítógéppel (AI) segített képanalízis hatékonyságát vizsgáljuk.

Ezen a területen a DE Klinikai Immunológiai és Reumatológiai Tanszékeivel van hosszú időre visszanyúló szoros munkakapcsolatunk.

2., Egy másik érdeklődési területünk a cirrhosishoz társuló fertőzések kimutatására és előrejelzésére használható biomarkerek azonosítása. A cirrhosis a különböző etiológiájú májbetegségek végső stádiuma és világszerte komoly egészségügyi probléma. A bakteriális fertőzések gyakori komplikációi a cirrhosisnak, melyek szignifikánsan növelik az állapot mortalitását részben azért is, mert egyértelmű a szerepük az életveszélyes "krónikus májelégtelenségre rakódó akut májkárosodás" (acute-on-chronic liver failure, ACLF) szindróma kialakulásában. Célunk olyan biomarkerek (mintázat felismerő molekulák, akut fázis fehérjék, anti-mikrobiális antitestek, autoantitestek, stb.) azonosítása és ezekből kompozit paraméterek készítése, amelyek segíthetnek a cirrhosishoz társuló fertőzés és egyéb komplikációk felismerésében és előrejelzésében. Ezen a területen a DE Gasztroenterológiai Klinikájával van hosszú időre visszanyúló szoros munkakapcsolatunk.

3., Az antibiotikum rezisztencia súlyos, globális méretű fenyegetés. A meglévő antibiotikumok hibás alkalmazása, és új antibiotikumok fejlesztésének hiánya (multi)rezisztens baktériumok, gombák és vírusok kialakulásához vezetett. A fertőzésekkel szembeni védekezés hatékonyságának fokozásához bővítenünk kell a terápiás beavatkozások körét. Munkánk célja új, antimikrobiális hatású, fúziós fehérjék fejlesztése. Egy ilyen molekula egyik fele ismert antimikrobiális fehérje aktív doménje, mely korokozók széles spektrumát képes felismerni. A másik fele pedig az immunglobulin G1 molekula Fc része, ami elősegíti az opszonizált kórokozók fagocita sejtek által történő, Fc receptor-mediálta felvételét, és az immunrendszer egyéb Fc receptorral bíró sejtjeit is aktiválja.

4., A korábban megkezdett projektjeink kapcsán is történnek újabb kísérletek. Tumoros betegek mintáiban monoklonális antitest alapú plazma proteom profilírozást végeztünk elsősorban tüdő tumoros beteget tesztelve és ezt a munkát más tumoros betegcsoportokra is tervezzük kiterjeszteni.

Alkalmazott módszerek: ELISA és indirect immunfluorescens assay-k, Western-blot és immunoblot, flow cytometria, PCR, RQ-PCR, DNS-szekvenálás, mAb-alapú chip technológia

A kutatómunkához kapcsolódó fontosabb közlemények listája:

1. Nagy, G., Földesi, R., Csípő, I., Tarr, T., Szűcs, G., Szántó, A., Bubán, T., Szekanecz, Z., Papp, M., Kappelmayer, J., Antal-Szalmás, P. A novel way to evaluate autoantibody interference in samples with mixed antinuclear antibody patterns in the HEp-2 cell based indirect immunofluorescence assay and comparison of conventional microscopic and computer-aided pattern recognition Clin. Chim. Acta. 553 1-9, 2024.
2. Lázár J, Antal-Szalmás P, Kurucz I, Ferenczi A, Józsi M, Tornyi I, Müller M, Fekete JT, Lamont J, FitzGerald P, Gall-Debreceni A, Kádas J, Vida A, Tardieu, N, Kieffer, Y, Jullien, A, Guergova-Kuras M, Hempel W, Kovács AL, Kardos T, Bittner N, Csánky E, Szilasi M, Losonczy G, Szondy K, Gálffy G, Csada E, Szalontai K, Somfay A, Malka D, Cottu P, Bogos K, Takács L. Large-scale plasma proteome epitome profiling is an efficient tool for the discovery of cancer biomarkers. Molecular & Cellular Proteomics 22 (7), 1-18, 2023
3. Tornai D, Vitális Z, Jónás A, Janka T, Földi I, Tornai TI, Sipeki N, Csillag A, Balogh B, Sümegi A, Földesi R, Papp M, Antal-Szalmás P. Increased sTREM-1 levels identify cirrhotic patients with bacterial infection and predict their 90-day mortality Clinics and Research in Hepatology and Gastroenterology 45 (5), 1-12, 2021.
4. Nagy G, Csípő I, Tarr T, Szűcs G, Szántó A, Bubán T, Sipeki N, Szekanecz Z, Papp M, Kappelmayer J, Antal-Szalmás P. Anti-neutrophil cytoplasmic antibody testing by indirect immunofluorescence: computer-aided versus conventional microscopic evaluation of routine diagnostic samples from patients with vasculitis or other inflammatory diseases Clinica Chimica Acta 511 117-124, 2020.
5. Mezei ZA, Tornai D, Földesi R, Madar L, Sümegi A, Papp M, Antal-Szalmás P. A DNA pool of FLT3-ITD positive DNA samples can be used efficiently for analytical evaluation of NGS-based FLT3-ITD quantitation: testing several different ITD sequences and rates, simultaneously, Journal of Biotechnology 303 25-29, 2019.
6. Nagy B Jr., Bhattoa HP, Steiber Z, Csobán M, Szilasi M, Méhes G, Müller M, Lázár J, Kappelmayer J, Antal-Szalmás P. Serum human epididymis protein 4 (HE4) as a tumor marker in men with lung cancer. Clinical Chemistry and Laboratory Medicine 52 (11), 1639-1648, 2014.
7. Papp M, Sipeki N, Vitális Z, Tornai TI, Altorjay I, Tornai I, Udvardy M, Fechner K, Jacobsen S, Teegen B, Sümegi A, Veres G, Lakatos P, Kappelmayer J, Antal-Szalmás P. High prevalence of IgA class anti-neutrophil cytoplasmic antibodies (ANCA) is associated with increased risk of bacterial infection in patients with cirrhosis. Journal of Hepatology 59 (3), 457-466, 2013.
8. Vida A, Bardoel, B, Milder, F, Majoros L, Sümegi A, Bácsi A, Vereb G, Kessel K P. M., van, Strijp, J. A. G., van, Antal-Szalmás P. Fusion of the Fc part of human IgG1 to CD14 enhances its binding to gram-negative bacteria and mediates phagocytosis by Fc receptors of neutrophils. Immunology Letters 146 (1-2), 31-39, 2012.
9. Papp M, Vitális Z, Altorjay I, Tornai I, Udvardy M, Hársfalvi J, Vida A, Kappelmayer J, Lakatos P, Antal-Szalmás P. Acute phase proteins in the diagnosis and prediction of cirrhosis associated bacterial infections. Liver International 32 (4), 603-611, 2012.
10. Bubán T, Koczok K, Földesi R, Szabó G, Sümegi A, Tanyi M, Szerafin L, Udvardy M, Kappelmayer J, Antal-Szalmás P. Detection of internal tandem duplications in the FLT3 gene by different electrophoretic methods. Clinical Chemistry and Laboratory Medicine 50 (2), 301-310, 2011.
11. Antal-Szalmás P. Evaluation of CD14 in host defence. European Journal of Clinical Investigation 30 (2), 167-179, 2000.